A Selye János Egyetem Reformárus Teológiai Kara nemzetközi együttműködés keretében a következő intézményekkel együtt vesz részt kutatási projektekben:

- Károli Gáspár Református Egyetem Hittudományi Kara Budapest

- Sárospataki Református Teológiai Akadémia

- Debreceni Református Hittudományi Egyetem

- Protestáns Teológiai Intézet

- Pápai Református Teológiai Akadémia

- Wuppertáli Bibliai szeminárium (gyakrolati-teológiai együtműkodésért és egyúttal a ösztöndíjasaknak)

- Prostestáns-Keresztyén főiskola és a Református szövetség Teológiai főiskolaja, Hollandia

- Károly Egyetem Evangelikus teológiai kara, Prága (együttműködés tudományi-pedagógiai szinten, például docensek habilitása és doktoranduszok posztgraduális képzésének lehetősége)

- Giesseni Teológiai akadémia, Németország (ösztöndíj diákjaink számára)

- Kolumbiai Egyetem Teológiai szemináriuma, USA (vendég előadások, sakkonzultáció)

- Komenius Egyetem Evangélikus teológiai kara Pozsonyban

- Heidelbergi Teológiai Kar Ökumenikus intézete, Németország (közös-programú együttműkodés és egyúttal ösztöndíj lehetőség diákok számára, valamint ösztöndíj postgraduális képzésre és további kutatási képzésre)